凈化工作臺必須在試車檢查良好的情況下，方可運用。啟動風機前必須對凈化工作臺和周圍環境進行認真的清潔工作，并進行適當的滅菌處理。凈化工作區內嚴禁存放不必要的物品，以保持潔凈氣流流型不受干擾。凈化工作區內盡量避免作明顯擾亂氣流流型的動作。
把經處理的物品、儀器及操作工具放在臺面上，然后接上電源，此時電源指示燈亮。按下殺菌開關，對工作臺內進行紫外滅菌30min以上。關閉殺菌開關，按下鼓風開關，風機正常運轉。凈化工作臺按下照明開關，便可進行操作，操作時操作工作人員只能手部在工作臺內操作，且操作區送風口之間不能有阻礙物。操作完畢，清理臺面，并用75%的酒精或適當的消毒液擦拭臺面消毒。
